Em sorteio realizado na sede da CBF, ficou definido os mandos de campo para as oitavas de final da Copa do Brasil. O Coritiba encara o Paysandu e o primeiro jogo será no estádio Couto Pereira, com data a ser definida. Assim como Atlético e Paraná que enfrentam respectivamente Cruzeiro e Palmeiras e fazem a primeira partida de ida como mandante.
Nesta fase não existe mais a vantagem da vitória por dois gols de diferença fora de casa no primeiro jogo. Além disso, a decisão dos mandos foi realizada por sorteio e não mais pelo ranking.
Dos quatro representantes do estado do Paraná na Edição de 2012, apenas o Operário não participa mais da competição, sendo eliminado ainda no jogo de ida pelo Juventude.